Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1DQ01668 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms