Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
IRF9Q00978 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms