Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5Q00535 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms