Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP4BP1P59074 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 443.7 ms