Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBASH3AP57075 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms