Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PGGT1BP53609 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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