Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARFIP2P53365 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms