Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFNA4P52798 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms