Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRE11P49959 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MRE11P49959 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRE11P49959 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRE11P49959 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRE11P49959 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms