Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRIM1P49642 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRIM1P49642 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms