Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PIP4K2AP48426 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PIP4K2AP48426 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms