Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRPPRCP42704 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRPPRCP42704 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms