Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BMI1P35226 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BMI1P35226 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms