Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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TSPOP30536 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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