Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRMP28827 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRMP28827 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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