Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HTR2AP28223 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms