Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CALB2P22676 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALB2P22676 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALB2P22676 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CALB2P22676 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms