Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FLT1P17948 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FLT1P17948 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FLT1P17948 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT1P17948 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT1P17948 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FLT1P17948 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT1P17948 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT1P17948 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FLT1P17948 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms