Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XBP1P17861 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XBP1P17861 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms