Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GNB3P16520 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GNB3P16520 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms