Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM27P14373 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms