Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RLBP1P12271 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RLBP1P12271 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms