Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms