Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP1P11387 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms