Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RARBP10826 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RARBP10826 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RARBP10826 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RARBP10826 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RARBP10826 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RARBP10826 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RARBP10826 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RARBP10826 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms