Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HKR1P10072 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HKR1P10072 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HKR1P10072 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HKR1P10072 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms