Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHV1-8P0DP01 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms