Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC192P0DO97 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms