Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD1P0DJD0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms