Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP1P09874 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP1P09874 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP1P09874 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP1P09874 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP1P09874 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARP1P09874 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARP1P09874 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARP1P09874 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARP1P09874 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms