Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ECM2O94769 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM2O94769 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM2O94769 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM2O94769 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ECM2O94769 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ECM2O94769 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ECM2O94769 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ECM2O94769 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms