Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKL5O76039 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms