Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLOT1O75955 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FLOT1O75955 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 531.3 ms