Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP2O75323 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP2O75323 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms