Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSX5O60225 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSX5O60225 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSX5O60225 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSX5O60225 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms