Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYNGR3O43761 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYNGR3O43761 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms