Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX6O43752 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STX6O43752 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STX6O43752 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STX6O43752 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX6O43752 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STX6O43752 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX6O43752 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms