Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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