Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1CO15160 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLR1CO15160 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms