Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
BCKDKO14874 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BCKDKO14874 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms