Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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