Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC182A6NF36 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms