Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BMS1P15-201ENST00000554269 1141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC022400.3-201ENST00000399449 3810 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC00663-203ENST00000586885 2546 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01427-202ENST00000635258 4566 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL137074.1-201ENST00000442640 465 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLN3Q13286 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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