Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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