Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CYP4A22-203ENST00000371891 2535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MAP3K8-202ENST00000375321 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LINC01232-204ENST00000626729 2796 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SUPT20H-205ENST00000464744 2625 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PAX6-259ENST00000639916 2622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 LINC02449-202ENST00000399866 517 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC010368.1-201ENST00000510160 456 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 IGLV1-41-201ENST00000519790 406 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 DRICH1-202ENST00000614553 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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MKRN3Q13064 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ADAM2-202ENST00000347580 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TBC1D5-219ENST00000446818 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PIWIL3-202ENST00000527701 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 GRHL1-201ENST00000324907 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC006017.1-201ENST00000424630 673 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
MKRN3Q13064 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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