Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IL31RA-203ENST00000359040 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTOMT-201ENST00000289488 2332 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL162293.1-201ENST00000373508 2112 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 A4GNT-201ENST00000236709 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023283.1-201ENST00000453491 4897 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GH2-201ENST00000332800 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CFL1P7-201ENST00000424759 486 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NPAP1P2-201ENST00000456716 1234 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073861.1-201ENST00000496294 459 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AL354919.2-201ENST00000527035 537 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms