Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQ87 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
U3KQ87 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
U3KQ87 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
U3KQ87 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQ87 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQ87 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQ87 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQ87 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQ87 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQ87 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms