Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HCN4Q9Y3Q4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HCN4Q9Y3Q4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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