Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAN1Q9Y2M0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms