Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SBNO2Q9Y2G9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SBNO2Q9Y2G9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms